消化內科的檢查有很多，最常見的就是胃腸鏡的檢查，還有幽門螺桿菌的相關檢查。如果病情需要，還需要進行腹部的CT，或者核磁檢查，以及必要時可能還需要頭顱CT，或者核磁或者全身的PET-CT檢查，其他的血液方面的檢查就是血常規、肝腎功能、電解質、血沉、C反應蛋白等等，還有的檢查有心電圖、胸部CT或者胸片檢查，以及消化道造影的檢查。內鏡方面的檢查除了胃腸鏡，還有膠囊內鏡，還有小腸鏡的檢查，這些代價都比較高，其他的檢查就需要根據病人的情況來進行選擇。